Λίγες ώρες έπειτα από την απόκτηση του Νέβεν Τζούρασεκ, η ΠΑΕ Άρης προχώρησε στην επισημοποίηση της συμφωνίας και με τον Τζόναθαν Ντιέγκο Μενέντεζ. Ο Αργεντινός εξτρέμ, που γεννήθηκε στις 5 Μαρτίου 1994 στο Μπουένος Άιρες της Αργεντινής, υπέγραψε συμβόλαιο ενός χρόνου με τους «κίτρινους», με τη δυνατότητα επέκτασης για δύο ακόμη χρόνια.
Ξεκίνησε την ποδοσφαιρική του καριέρα από την Τσακαρίτα Τζούνιορς, ομάδα της πόλης του. Αφού έφτασε μέχρι την πρώτη ομάδα της Τσακαρίτα, ο Μενέντεζ δοκίμασε για πρώτη φορά την τύχη του εκτός Αργεντινής το 2012, υπογράφοντας στην ισπανική Σεβίλλη. Μετά από 56 συμμετοχές και 4 γκολ με τη δεύτερη ομάδα της Σεβίλλης, o 29χρονος Αργεντινός μεσοεπιθετικός επέστρεψε στην γνώριμη Τσακαρίτα Τζούνιορς το 2015.
Εκεί πρόλαβε να αγωνιστεί 16 φορές (3 γκολ) στην Primera B, πριν φύγει για την Ταγιέρες το καλοκαίρι του 2016, όπου πέρασε μια σπουδαία διετία δείχνοντας πραγματικά τις ικανότητές του (31 συμμετοχές, 10 γκολ) στην Primera Division. Η Ιντεπεντιέντε αναγνώρισε την αξία του και τον αγόρασε τον Ιανουάριο του 2018. Ο Μενέντεζ παραχωρήθηκε στη συνέχεια δύο φορές δανεικός. Για ένα εξάμηνο στην Αλ-Ραγιάν του Κατάρ και για ακόμη ένα χρόνο στην Ταγιέρες, όπου βρήκε πάλι περισσότερο χρόνο συμμετοχής.
Το καλοκαίρι του 2021 ο «Τζόνι» γνώρισε την εμπειρία της Major League Soccer, αγωνιζόμενος με τη φανέλα της Ρεάλ Σολτ Λέικ σε μια «γεμάτη» πρώτη σεζόν. Η προηγούμενη αγωνιστική περίοδος βρήκε τον Μενέντεζ να επιστρέφει ξανά στη χώρα του αυτή τη φορά για να αγωνιστεί με τη φανέλα της Βελέζ Σάρσφιλντ στο πρώτο μισό της σεζόν και με τη Νιούελς Ολντ Μπόις στο δεύτερο μισό της σεζόν (17 αγώνες συνολικά).
Μετά την υπογραφή του συμβολαίου, ο Μενέντεζ μίλησε στην επίσημη ιστοσελίδα του Άρη:
«Είμαι χαρούμενος που υπέγραψα στον Άρη. Γνωρίζω πολύ καλά ότι έχω έρθει σε μια από τις μεγαλύτερες ομάδες της Ελλάδας με φανατικούς οπαδούς, οι οποίοι βρίσκονται πάντα στο πλευρό της και την στηρίζουν με πάθος. Ανυπομονώ να γνωρίσω τον νέο μου προπονητή και τους συμπαίκτες μου και να ξεκινήσω προπονήσεις.
Υπόσχομαι ότι θα δουλέψω σκληρά και θα βοηθήσω με όλες μου τις δυνάμεις τον Αρη για να έχουμε μια πετυχημένη ποδοσφαιρική χρονιά τόσο στην Ελλάδα όσο και στην Ευρώπη και να πετύχουμε τους στόχους μας. Τα υπόλοιπα θα τα πούμε στο γήπεδο... ».