Με Λεβαδειακό, Απόλλων Πόντου και μία ομάδα εκ των Αιγιανιακού και Βέροιας θα βρεθεί στον 2ο όμιλο ο ΠΑΟΚ για το κύπελλο Ελλάδας, σε κλήρωση που πραγματοποιήθηκε στα γραφεία της ΕΠΟ και αφορά τόσο την πρώτη όσο και τη δεύτερη φάση.
Ο Άρης θα βρεθεί στον 7ο όμιλο με Πανιώνιο, ΠΑΣ Γιάννινα και Παναιγιάλειο, ενώ ο Ηρακλής κληρώθηκε στον 1ο όμιλο με Απόλλων Σμύρνης, ΟΦΗ και Πλατανιά.
Ο Ολυμπιακός θα συναντήσει στον 5ο όμιλο τους Αστέρα Τρίπολης, Αχαρναϊκό και Κισσαμικό. Η ΑΕΚ στον τρίτο όμιλο θα τεθεί αντιμέτωπη με Λαμία, Απόλλωνα Λάρισας και Καλλιθέα, ενώ ο Παναθηναϊκός στον 8ο όμιλο θα παίξει με ΑΕΛ, Αναγέννηση Καρδίτσας και Παναχαϊκή.
Οι αγώνες στους ομίλους είναι μονοί. Δηλαδή σε κάθε γκρουπ θα γίνουν τρία ματς. Τα παιχνίδια είναι προγραμματισμένα για τις εξής ημερομηνίες: 19-21/9, 24-26/10 και 28-30/11. Την πρόκριση στην γ' φάση εξασφαλίζουν οι ομάδες που θα τερματίσουν στις πρώτες δύο θέσεις.
Η κλήρωση της πρώτης φάσης έγινε με 17 ομάδες, αφού δεν έχει ξεκαθαρίσει το θέμα της συμμετοχής 18ης ομάδας στο πρωτάθλημα. Για να έμεναν 16 οι ομάδες της Football League που θα έμπαιναν στους ομίλους της διοργάνωσης, θα πρέπει να γίνει η α' φάση, με ένα ζευγάρι που θα δώσει διπλούς αγώνες στις 19 Αυγούστου και στις 29 Αυγούστου. Και αυτό το ζευγάρι συγκροτείται από Αιγινιακό - Βέροια.
Αναλυτικά, οι όμιλοι:
1ος όμιλος
Πλατανιάς, Απόλλων Σμύρνης, ΟΦΗ, Ηρακλής
2ος όμιλος
ΠΑΟΚ, Λεβαδειακός, Απόλλων Πόντου, Νικητής α' γύρου (Αιγινιακός ή Βέροια)
3ος όμιλος
ΑΕΚ, Λαμία, Απόλλων Λάρισας, Καλλιθέα
4ος όμιλος
Ατρόμητος, Κέρκυρα, Τρίκαλα, Σπάρτη
5ος όμιλος
Ολυμπιακός, Αστέρας Τρίπολης, Αχαρναϊκός, Κισσαμικός
6ος όμιλος
Ξάνθη, Παναιτωλικός, Εργοτέλης, Πανσερραϊκός
7ος όμιλος
Πανιώνιος, ΠΑΣ Γιάννινα, Άρης, Παναιγιάλειος
8ος όμιλος
Παναθηναϊκός, ΑΕΛ, Αναγέννηση Καρδίτσας, Παναχαϊκή