Ο στόχος διατήρησης αποτελεί τον ελάχιστο αριθμό ατόμων των σημαντικών ειδών ορνιθοπανίδας, που πρέπει να υπάρχουν σε κάθε ΖΕΠ του δικτύου
Οι τοπικοί στόχοι διατήρησης για είδη ορνιθοπανίδας στις Ζώνες Ειδικής Προστασίας (ΖΕΠ) του δικτύου Natura 2000 καθορίζονται για πρώτη φορά στο σύνολο της επικράτειας με Υπουργική Απόφαση, που υπέγραψε ο υφυπουργός Περιβάλλοντος και Ενέργειας, Γιώργος Αμυράς.
Η Υπουργική Απόφαση αυτή, καθώς και η Υπουργική Απόφαση καθορισμού στόχων διατήρησης για φυσικούς οικοτόπους και είδη ενωσιακού ενδιαφέροντος, καλύπτουν από κοινού μεγάλο μέρος των υποχρεώσεων που απορρέουν από την ενωσιακή νομοθεσία για τις περιοχές Natura και για τη μη συμμόρφωση στις οποίες είχε καταδικαστεί η χώρα μας στο Δικαστήριο της Ευρωπαϊκής Ένωσης, σύμφωνα με το ΥΠΕΝ.