Περαιτέρω έρευνα παρήγγειλε ο εισαγγελέας εγκλημάτων διαφθοράς Θεσσαλονίκης Αργύρης Δημόπουλος σχετικά με τη διαχείριση του Ειδικού Λογαριασμού Κονδυλίων Έρευνας, στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, και την καταβολή του νόμιμου ποσοστού από τους καθηγητές πανεπιστημίου που εργάζονται παράλληλα και ως ελεύθεροι επαγγελματίες.
Σύμφωνα με δικαστική πηγή, ο εισαγγελέας έχει αναλάβει προσωπικά την εποπτεία της υπόθεσης στοχεύοντας στην κάθαρση του δημόσιου τομέα και ειδικά του πανεπιστημιακού χώρου. Ζήτησε από την επίκουρη εισαγγελέα διαφθοράς Αναστασία Καλαϊτζή, που χειρίζεται την υπόθεση, να γίνει ενδελεχής έρευνα και να αναθέσει στο ΣΔΟΕ την λήψη ανωμοτί καταθέσεων από μέλη της Επιτροπής που διαχειρίζεται τα κονδύλια και άλλα εμπλεκόμενα μέλη του Διδακτικού Ερευνητικού Προσωπικού.
Η προκαταρκτική εξέταση ξεκίνησε για να διακριβωθεί αν στοιχειοθετούνται τα κακουργήματα της υπεξαίρεσης στην υπηρεσία, της υπηρεσιακής απιστίας και της απάτης σε βάρος Νομικού Προσώπου Δημοσίου Δικαίου, δηλαδή του ΑΠΘ, κατ΄εξακολούθηση, κατ' επάγγελμα και κατά συνήθεια. Μετά τον έλεγχο του ΕΛΚΕ από τους οικονομικούς επιθεωρητές για τη διαχείριση των τελευταίων 15 ετών προέκυψαν τα παρακάτω επιλήψιμα ευρήματα:
1. Μη νόμιμη πληρωμή 4,5 εκατ. ευρώ από τον ειδικό λογαριασμό του ΑΠΘ που αφορά σε συμβάσεις με αναδρομικές ημερομηνίες έναρξης συνεργατών των επιστημονικά υπευθύνων στα πλαίσια ερευνητικών έργων.
2. Διαπίστωση φοροδιαφυγής από μεγάλο μέρος των επιστημονικά υπευθύνων (μέλη ΔΕΠ) οι οποίοι δεν δήλωναν τις αποζημιώσεις που λάμβαναν σε ερευνητικά προγράμματα του ΕΛΚΕ του ΑΠΘ. Της υποθέσεως επιλαμβάνεται το ΣΔΟΕ που διεξάγει ήδη έρευνα καθώς διαπιστώθηκε ότι το συντριπτικό ποσοστό των καθηγητών απέκρυπτε τις πρόσθετες αμοιβές που έφθαναν μέχρι το 100% των τακτικών αποδοχών τους. Οι συνολικές αμοιβές από τον ΕΛΚΕ ανέρχονται στα 37 εκατ. ευρώ.
3. Ενδείξεις κακοδιαχείρισης κονδυλίων από την εταιρεία αξιοποίησης περιουσίας του ΑΠΘ η οποία αναλάμβανε να εκτελέσει αρκετά ερευνητικά έργα του ΕΛΚΕ κατόπιν της ανωτέρω επισήμανσης έχει ήδη ζητηθεί από τον αρμόδιο εισαγγελέα νέος αυτόνομος διαχειριστικός έλεγχος. Επίσης θα ελεγχθεί η νομιμότητα του έργου κατασκευής του ιδιόκτητου κτιρίου του ΕΛΚΕ, από το Σώμα Επιθεωρητών Δημοσίων Έργων.
4. Εύρεση εικονικών και παραποιημένων - ανύπαρκτων αραστατικών ποσού 340.000 ευρώ σε δαπάνες ερευνητικών προγραμμάτων τεσσάρων καθηγητών του ΑΠΘ.
5. Εύρεση δαπανών ποσού 90.000 ευρώ που αφορούσαν γεύματα που πραγματοποιήθηκαν στα πλαίσια εκτέλεσης των ερευνητικών έργων για τα οποία δεν προκύπτει απ' τα σχετικά παραστατικά ότι συνέβαλαν στους σκοπούς τους. Επίσης εύρεση υλικών για ερευνητικά έργα που δεν χρησιμοποιήθηκαν.
6. Εντοπισμός περιπτώσεων διπλοπληρωμών που αφορούσαν σε αποζημιώσεις μετακινήσεων καθηγητών από διαφορετικούς φορείς για την ίδια αιτία αλλά και μετακινήσεις που είναι αδύνατο να πραγματοποιήθηκαν.
7. Κακοδιαχείριση των διαθεσίμων του ΕΛΚΕ για την περίοδο 2005-2010. Περίπου 25 εκατ. ευρώ δεν διαχειρίστηκαν με επωφελή τρόπο από την Επιτροπή Ερευνών καθώς ήταν τοποθετημένα σε τράπεζα, σε λογαριασμό όψεως με επιτόκιο 0,7% ενώ ήταν δυνατόν να τοποθετηθούν σε προθεσμιακές καταθέσεις. Αυτό έγινε το 2010 και απέφερε κέρδη 1,3 εκατ. ευρώ (επιτόκιο 7,8%). Από τις καταθέσεις αυτές , κατά το διάστημα της μικρής τοκοφορίας, επωφελήθηκε η τράπεζα, σύμφωνα με την έκθεση των επιθεωρητών.
8. Πλημμελής διαχείριση μεγάλου ποσού προκαταβολών (ενός εκατομμυρίου συνολικά) που αφορούσαν σε δαπάνες δικαιούχων του προγράμματος από μέλος ΔΕΠ χωρίς να αποδεικνύεται η ολική ή μερική καταβολή των ποσών αυτών με αντίστοιχα παραστατικά στους δικαιούχους. Ευθύνη δημοσίου υπολόγου έχει συγκεκριμένη καθηγήτρια του ΑΠΘ στην οποία πρέπει να καταλογιστεί το παραπάνω έλλειμμα, όπως αναφέρεται στην έκθεση των επιθεωρητών.
9 Ύπαρξη αμφιβολίας για την πραγματοποίηση πολλών μετακινήσεων σε προορισμούς χωρίς διόδια των μελών ΔΕΠ. Σημειώνεται ότι απ' αυτές τις μετακινήσεις ορισμένοι καθηγητές εισέπρατταν έως και 28.000 ευρώ ετησίως ενώ για κάποιους έχει εξακριβωθεί η μη πραγματοποίηση αυτών των μετακινήσεων, όπως αναλύονται στα ευρήματα της έκθεσης.